本书讲述了任性而孤僻的富家小女孩玛丽因为一场突来的瘟疫变成了孤儿，被送往英国一处古老庄园里的姑父家中。玛丽发现了一座荒废了十年的秘密花园，认识了活泼天真的少年迪克。在悉心照料花园的过程中，玛丽渐渐敞开心扉，去接纳周遭的人和事物。玛丽的表兄柯林生来体弱，长年卧病在床，性情乖戾难测。为了帮助柯林，玛丽带他进入了秘密花园。孩子们在生机蓬勃的小天地里不受干扰地玩耍，学会了友爱待人，恢复了纯真快乐的天性。